Музей Литовской Архитектуры был основан в 1968 году как филиал Литовского Национального музея. Сегодня музей является подразделением Центра Культурного Наследия. Первая выставка современной литовской архитектуры состоялась в 1972 году, когда музей получил постоянное помещение в здании церкви Святого Михаила. Эта знаменитая церковь и примыкающий к ней бернардинский монастырь были построены в 1594-1625 гг. и входят в число самых значительных архитектурных ансамблей Вильнюса эпохи ренессанса. Церковь также являлась фамильным мавзолеем гетмана Великого княжества Литовского Леонаса Сапеги.
     Внешний вид здания гармонично сочетает в себе черты, характерные для готики, барокко и эпохи ренессанса. В 1976 году экспозиция музея была перемещена в коридор на первом этаже бывшего бернардинского монастыря. В 1986 году музей занял весь комплекс монастыря. После восстановления независимости Литвы в 1990 году оба здания были возвращены законным владельцам. Сегодня музей функционирует на правах аренды.
     Коллекция музея состоит, в основном, из чертежей, рисунков, планов города, фотографий, керамики.
     Экспозиция музея условно делится на две части:
     - Литовская архитектура 1918-1940 годов, которая рассказывает об организации творческих союзов инженеров и архитекторов, восстановлении деятельности различных институтов в стране.
     - Литовская архитектура 1944-1990 годов, которая знакомит с архитектурой периода сталинизма и более поздними достижениями литовских архитекторов советской эпохи в планировании жилых районов и проектировании общественных зданий.
    Музей принимает участие в различных культурных и образовательных мероприятиях совместно с литовским Союзом Архитекторов и публикует материалы об исторических архитектурных памятниках Литвы.